การได้รับไอโอดีนที่ใช้ในหัตถการทางการแพทย์ในหออภิบาลทารกแรกเกิดอาจเพิ่มความเสี่ยงของทารกต่อภาวะไทรอยด์ทำงานต่ำแต่กำเนิด ทารกที่ได้รับการวินิจฉัยว่ามีภาวะไทรอยด์ทำงานต่ำแต่กำเนิดหลังจากพักรักษาตัวมีระดับไอโอดีนในเลือดสูงกว่าโดยเฉลี่ยกว่าทารกที่เข้าพัก แต่มีการทำงานของต่อมไทรอยด์ตามปกติ การจำกัดการรับสารไอโอดีนในกลุ่มทารก

กลุ่มนี้ทุกครั้งที่ทำได้อาจช่วยลดความเสี่ยงในการสูญเสียการทำงานของต่อมไทรอยด์ได้ hypothyroidism แต่กำเนิดเป็นการสูญเสียการทำงานของต่อมไทรอยด์บางส่วนหรือทั้งหมด ไทรอยด์ที่อยู่ในลำคอสร้างฮอร์โมนที่มีไอโอดีนซึ่งควบคุมการเจริญเติบโต การพัฒนาสมอง และอัตราการเกิดปฏิกิริยาเคมีในร่างกาย การรักษาประกอบด้วยการบำบัดด้วยฮอร์โมนไทรอยด์และต้องเริ่มภายในสี่สัปดาห์หลังคลอด มิฉะนั้นอาจส่งผลให้เกิดความพิการทางสติปัญญาอย่างถาวร ในสหรัฐอเมริกา ทารกทุกคนจะได้รับการตรวจคัดกรองภาวะดังกล่าวเป็นประจำ โดยการเก็บตัวอย่างเลือดจำนวนเล็กน้อยจากส้นเท้าของทารกและวิเคราะห์หาฮอร์โมนกระตุ้นต่อมไทรอยด์ ทารกที่มีฮอร์โมนกระตุ้นต่อมไทรอยด์ในระดับสูงจะถูกส่งต่อเพื่อทำการทดสอบต่อไป